home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00057 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  1.5 KB  |  33 lines
  1. *************************************************************
  2. * DNA mismatch repair proteins mutL / hexB / PMS1 signature *
  3. *************************************************************
  4.  
  5. Mismatch repair contributes to the overall fidelity of DNA replication [1]. It
  6. involves the correction of mismatched base pairs that  have been missed by the
  7. proofreading  element  of the DNA polymerase complex.     The sequence of some
  8. proteins involved in mismatch repair in different organisms have been found to
  9. be evolutionary related. These proteins are:
  10.  
  11.  - Escherichia coli and  Salmonella typhimurium  mutL  protein [2].   MutL  is
  12.    required for dam-dependent methyl-directed DNA repair.
  13.  - Streptococcus pneumoniae hexB protein [3]. The Hex system is nick directed.
  14.  - Yeast PMS1 protein [4].
  15.  
  16. As a signature pattern for  this class of mismatch repair proteins we selected
  17. a  perfectly conserved octapeptide  which is located in the N-terminal section
  18. of these proteins.
  19.  
  20. -Consensus pattern: L-G-F-R-G-E-A-L
  21. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  22. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  23. -Last update: December 1991 / Text revised.
  24.  
  25. [ 1] Modrich P.
  26.      Annu. Rev. Biochem. 56:435-466(1987).
  27. [ 2] Mankovich J.A., McIntyre C.A., Walker G.C.
  28.      J. Bacteriol. 171:5325-5331(1989).
  29. [ 3] Prudhomme M., Martin B., Mejean V., Claverys J.-P.
  30.      J. Bacteriol. 171:5332-5338(1989).
  31. [ 4] Kramer W., Kramer B., Williamson M.S., Fogel S.
  32.      J. Bacteriol. 171:5339-5346(1989).
  33.